É considerada endometriose profunda somente a situação na qual implantes endometriais penetram as paredes vesicais ou intestinal, chegando à mucosa.

O tratamento de primeira escolha é feito com análogo de GnRh, caso a paciente não tenha desejo reprodutivo no momento do diagnóstico.

O dienogeste é um progestágeno com atividade antiestrogênica e pro-androgênica que pode ser utilizado no tratamento da endometriose.

A endometriose é uma condição crônica cuja patogênese não foi definitivamente estabelecida e parece ser multifatorial, incluindo alterações imunológicas, proliferação celular desequilibrada, apoptose e sinalização endócrina aberrante, porém, ao contrário de outras doenças crônicas, entre as causas envolvidas, parece não haver fatores genéticos.

Existem estudos epidemiológicos relacionandos à ocorrência de endometriomas com risco aumentado para câncer de ovário.