O único parâmetro microbiológico estabelecido para mel é ausência de Clostridium botulinum 

Excetuam-se da necessidade de pesquisa regular de Listeria monocytogenes os alimentos com pH menor ou igual a 5,0 e atividade de água menor ou igual a 0,94

A pesquisa de Histamina (mg/Kg) deve ser realizada somente para peixes com elevado teor de histidina (algumas famílias específicas), sendo que nenhuma unidade amostral pode apresentar resultado superior a 250 mg/kg (duzentos e cinquenta miligramas por quilograma)

Carnes bovinas, suínas e de outras espécies cruas, maturadas ou não, temperadas ou não, refrigeradas ou congeladas, embaladas a vácuo ou não, miúdos, toucinho e pele devem passar por pesquisa de Clostridium perfringens, sendo o critério aceitável a ausência em 25g 

As enterotoxinas estafilocócicas deverão ser pesquisadas somente em alguns produtos da categoria Leite e Derivados, sendo seu o limite de detecção menor ou igual a 1 (um) nanograma por grama (ng/g)