A temperatura corporal de répteis está diretamente relacionada com a taxa metabólica e exerce efeito decisivo na cinética da maioria dos fármacos administrados. Porém, como já estão adaptados, situações de hipotermia não interferem na biotransformação dos fármacos, não influenciando no período de ação e recuperação.

Os tubos utilizados para intubação de mamíferos devem ser a primeira escolha para aves. De maneira geral, são priorizados tubos com balonete insuflado. Aves têm anéis traqueais fechados e desta forma há redução do espaço morto traqueal.

Em aves que apresentam alterações respiratórias, como aerossaculite, doença no trato respiratório superior ou doença cardíaca, a pré-oxigenação antes de iniciar a anestesia inalatória ou injetável não traz benefícios, pois com o tecido inflamado não irá ocorrer adequada absorção, além de potencial estresse com consequente piora da dispneia. 

Como os répteis têm baixo metabolismo, a perfusão pulmonar, a capacidade de difusão de oxigênio e a ventilação também são baixas. Com isso, a ventilação pulmonar é intermitente com períodos de apneia, sem refletir em deficiência ou controle impreciso da respiração. Na maioria das situações, quando for alcançado plano anestésico que possibilite a realização de cirurgias, é observada apneia e o paciente deve ser ventilado com um volume tidal adequado e baixa frequência respiratória.