O objeto da auditoria operacional limita-se a programas, a entidades ou a fundos.

A auditoria operacional promove a accountability ao ajudar aqueles com responsabilidades de governança e supervisão a melhorar o desempenho. Isso é feito ao examinar se as decisões tomadas pelo poder legislativo ou pelo executivo são formuladas e implementadas de forma eficiente e eficaz e se os contribuintes ou cidadãos têm recebido em retorno o valor justo dos tributos pagos.

A auditoria operacional deve questionar as intenções e as decisões do poder legislativo, além de examinar se há alguma deficiência nas leis e nos regulamentos ou na sua forma de implementação que esteja impedindo que os objetivos especificados sejam alcançados.  

Os auditores não precisam gerenciar riscos ativamente.