A territorialização fundamenta-se na divisão geopolítica administrativa, priorizando a cobertura populacional por meio de ações programáticas de vigilância epidemiológica e sanitária integradas aos serviços de média complexidade.

A territorialização orienta-se pela densidade demográfica e capacidade instalada, estabelecendo áreas de abrangência para vigilância através de indicadores socioeconômicos e epidemiológicos regionais.

A territorialização baseia-se na regionalização sanitária, promovendo ações de vigilância coordenadas exclusivamente pelos gestores municipais.

A territorialização é a base do trabalho das equipes de atenção básica para a prática da vigilância em saúde, caracterizando-se por ações individuais e coletivas de promoção, proteção, prevenção, diagnóstico, tratamento e reabilitação. 

A territorialização estrutura-se através de microrregiões de saúde, definindo responsabilidades sanitárias compartilhadas entre municípios para execução de ações especializadas de vigilância.