A profilaxia antimicrobiana deve ser realizada em qualquer procedimento envolvendo manipulação do tecido gengival, região periapical ou perfuração da mucosa oral em paciente com doença valvar cardíaca, podendo ser realizada com amoxicilina ou clindamicina em pacientes alérgicos a penicilina.

Os novos Critérios de Duke (2023) pouco se alteraram em relação aos critérios anteriores (2000), com inclusão de novos critérios menores entre os fatores de risco adicionais como a presença de dispositivos cardíacos permanentes (CDI e marca passo definitivo), além de abscessos esplênicos e cerebrais.

A terapia empírica em pacientes graves e com valvas nativas pode ser iniciada com ceftriaxone, sem necessidade de associação de outros antimicrobianos considerando epidemiologia mais prevalente para estreptococos e estafilococos.

A transição para antibioticoterapia oral é uma opção para pacientes em tratamento de endocardite infecciosa com qualquer perfil microbiológico desde que paciente esteja estável, afebril e com tempo de antimicrobiano endovenoso > 7 dias.