Ibirataia foi fundada em 1933, tendo suas origens ligadas à exploração de ouro e pedras preciosas. 

O primeiro prefeito foi José Passos Prazeres. 

Seus habitantes vieram principalmente da costa do Dendê, atravessando a mata com suas tropas para trocar suas mercadorias por uma planta medicinal muito utilizada na época, a Ipeca, por isso muitos a chamavam de Ipecacuanha. 

O nome Ibirataia significa "terra de muitas águas" em Tupi, refletindo a abundância de rios na região.