Os serviços de saúde devem ser organizados em níveis decrescentes de complexidade, circunscritos a uma determinada área geográfica, planejados a partir de critérios epidemiológicos e com definição e conhecimento da população a ser atendida.

Conselhos e Conferências de Saúde têm por finalidade formular estratégias, controlar e avaliar a execução da política de saúde. 

No SUS, a responsabilidade pela saúde deve ser centralizada até a Federação, ou seja, devem ser fornecidas à Unidade Federativa condições gerenciais, técnicas, administrativas e financeiras para exercer a função de prestar serviços com maior qualidade e garantir o controle e a fiscalização por parte dos cidadãos. 

Cada esfera de governo apresenta suas decisões e atividades para outra esfera superior, no caso a Federação, respeitando os princípios gerais e a participação da sociedade. 

Cada esfera pública tem seu próprio comando, sendo ele dividido entre as esferas Municipais, Estaduais e Federais.