A abordagem inicial inclui melhoria dos hábitos de vida e continuação da terapia dietética. 

Caso não haja melhora com a abordagem inicial, recomenda-se o uso de probióticos e medicamentos antidiarreicos, como loperamida. 

Após exclusão de diarreia crônica secundária, as opções terapêuticas incluem antagonistas de receptores 5HT3, anticolinérgicos, psicoterapia, antibióticos, agentes de volume, agonistas adrenérgicos e análogos da somatostatina, reconhecidos como tendo eficácia clara e bem estabelecida. 

Se houver melhora com probióticos e/ou medicamentos antidiarreicos, deve-se continuar a terapia atual.