Deficiência Intelectual e Transtorno do Espectro Autista costumam ser comórbidos. Para que se faça o diagnóstico da comorbidade, a comunicação social deve estar abaixo do esperado para o nível geral do desenvolvimento.

De acordo com o DSM-5, o Transtorno do Espectro Autista apresenta déficits na comunicação e interação social e padrões restritos e repetitivos de comportamentos, interesses ou atividades presentes antes dos 3 anos de idade, com prejuízo clinicamente significativo e não melhor explicado por deficiência intelectual ou atraso global do desenvolvimento.

A presença ou ausência de deficiência intelectual e comprometimento da linguagem associado, bem como outros problemas de saúde mental, são os melhores fatores prognósticos para as evoluções individuais no Transtorno do Espectro Autista.

Antipsicóticos costumam ser usados para tratamento de sintomas-alvo, como agressividade e automutilações, sendo a risperidona aprovada pelo FDA (Food and Drug Administration) para o tratamento de alterações comportamentais no autismo desde 2006.

De acordo com o DSM-5, a Deficiência Intelectual (Transtorno do Desenvolvimento Intelectual) é especificada em termos de gravidade com base no funcionamento adaptativo, e não em escores de QI, uma vez que é o funcionamento adaptativo que determina o nível de apoio necessário.