A Secretaria Municipal de Saúde reorganizou sua estrutura interna. Foram criados, então, departamentos distintos para Recursos Humanos, Compras, Vigilância em Saúde e Atenção Básica, e centralizou-se as decisões estratégicas na direção-geral. Embora essa mudança estrutural tenha feito com que as rotinas fossem padronizadas, ela também causou o aumento de conflitos intersetoriais. Com base na teoria administrativa, a estrutura adotada caracteriza-se como departamentalização: