Atualmente, há que se considerar que o flúor, isoladamente, não impede a perda de mineral da estrutura dentária, mas contribui para a redução dessa perda de forma significativa, e que o controle da dieta cariogênica parece ser importante no controle da cárie.

O uso do flúor tem sido visto com mais cautela do que antigamente devido ao risco de fluorose e câncer. A fluoretação das águas como meio de administração de flúor tem sido considerada suficiente para o controle da cárie, devendo haver interferências mais expressivas quando à dieta e à higienização mecânica da placa dentária.

O flúor possui capacidade bactericida, pois, uma vez disponível topicamente na cavidade bucal, é absorvido pelo microrganismo e, no seu interior, interfere na atividade enzimática e no controle do pH intracelular, reduzindo a produção de ácidos.

Quando se interrompe a ingestão de flúor o organismo não tem mecanismos para manter sua constância em qualquer dos seus compartimentos.