Sempre observar a quantidade máxima de animais por gaiola. Para ratos e camundongos adultos, pode-se utilizar a densidade populacional de 10 e 20 animais, em gaiolas/caixas de policarbonato cristal nas dimensões de 49x34x16cm e 30x19x13cm, respectivamente. Essa densidade populacional otimiza o espaço do biotério de experimentação, e atende aos princípios de bem-estar animal e experimentação.

Os animais devem ser alimentados todos os dias, entretanto a ração só deverá ser acrescentada às gaiolas, no momento da sua troca. Caso não haja ração para os animais na gaiola em um determinado dia, e neste mesmo dia não houver necessidade de troca, a ração deverá ser adicionada no dia determinado e planejado para a troca e manejo geral da gaiola. 

Geralmente, a limpeza e troca das gaiolas nas instalações animais (biotérios) é realizada de duas a três vezes por semana, ou até mesmo em dias alternados. Esse manejo pode ser modificado e adequado de acordo com a quantidade de animais por gaiola (densidade populacional), qualidade e características da cama (maravalha), ou sistema de manutenção das gaiolas na instalação animal (biotério). 

Para o manejo dos bebedouros, deve-se ter cuidado ao fechá-lo para evitar vazamento deles dentro da gaiola em que os animais estão alocados. Devido ao consumo hídrico dos animais, é importante que, durante as trocas e manejo das gaiolas, o manipulador complete o nível de água em cada bebedouro, para que os animais não sejam privados do consumo de água, e assim não desidratem durante o período experimental. Os bebedouros devem ser trocados e lavados a cada 15 dias ou mensalmente. 

A maravalha é o material mais utilizado para forrar as gaiolas, com a finalidade de absorver a umidade proveniente das fezes e urina, bem como manter o equilíbrio térmico do ambiente. Deve ser autoclavada antes do uso, para estar isenta de substâncias químicas tóxicas, de microrganismos, além de diminuir o conteúdo de resinas e óleos essenciais. O seu descarte pode ser feito junto ao lixo comum.