A Cromatografia Líquida de Alta Eficiência (CLAE) necessita de um preparo de amostras complexo a fim de prevenir o entupimento da coluna cromatográfica, que é muito estreito, devido ao denso empacotamento da fase estacionária. Esse sistema funciona com alta pressão.

Na cromatografia, a teoria do processo de separação é baseada na Equação de Van Deemter.

A CLAE faz uso de uma série de detectores; entre eles está o de arranjo de diodos (DAD). Trata-se de um detector universal para compostos cromóforos, gerando um espectro inteiro da substância, que pode ser comparado com bancos de dados de espectros para auxiliar na identificação do pico.

Na CLAE em fase reversa, é fundamental que os solventes constituintes da fase móvel sejam os mais apolares possíveis.

A CLAE usa um sistema de bombeamento de solventes para a eluição da sua fase móvel. Essa eluição pode ser isocrática (usa composição constante de solventes ao longo da corrida) ou por gradiente (a composição varia ao longo da corrida).