A maior parte do fingerprinting de DNA utiliza polimorfismos de nucleotídeo único.

O sequenciamento de DNA pelo método didesoxi de Sanger é uma das tecnologias de sequenciamento de próxima geração, sendo mais rápido e menos dispendioso que o método tradicional. 

O sequenciamento illumina emprega uma tecnologia semelhante à do método didesoxi de Sanger já que possui nucleotídeos marcados com diferentes fluorescências e cada nucleotídeo possui um terminador, embora os terminadores sejam reversíveis no sequenciamento illumina. 

Polimorfismos de comprimento do fragmento de restrição são mutações sinônimas associadas com manifestações de doenças.