Existe semelhança entre o processo formativo de barreira dentinária do hidróxido de cálcio e do MTA, sendo que a qualidade da mesma também se assemelha, sendo levemente superior no MTA.

O fosfato de cálcio presente na formulação do MTA, interage com a água presente nos líquidos tissulares, comportando-se então como um cimento de hidróxido de cálcio. 

Íons hidroxila, liberados pela dissociação iônica do MTA, formados através da zona de necrose, proporcionam no tecido subjacente um pH adequado ao reparo.

O mecanismo do reparo pulpar produzido pelo MTA, como decorrente de sua ação cáustica sobre este tecido, provoca uma desnaturação proteica, formando-se então uma zona de necrose de coagulação, que está presente entre o material e a barreira neoformada.

A barreira de dentina neoformada após o uso do MTA proporciona selamento biológico e possui qualidade semelhante àquela formada pelo hidróxido de cálcio.