As fissuras orofaciais podem ser um elemento diante de um quadro sindrômico mais complexo ou podem ser fissuras típicas/não sindrômicas. 

As formas não sindrômicas têm etiologia multifatorial, sugerindo interação entre suscetibilidade genética e aspectos ambientais. 

Evidencia-se ainda que lactentes com FP apresentam rajadas de sucção mais curtas e rápidas e maior taxa de deglutição, gerando aumento de pressão negativa. Em razão disso, tendem a consumir mais leite e ganhar mais peso.

Nas formas sindrômicas de causa genética, os genes responsáveis pela malformação não são completamente conhecidos. 

Quanto à classificação das FLP, Spina, utilizando um sistema de classificação já existente, associou os prefixos “pré”, “trans” e “pós” à expressão “forame incisivo”, local representado por um ponto que delimita os palatos primário e secundário.