A terapia de redução septal é recomendada em pacientes com síncope de esforço causada por gradiente de repouso ou provocado na via de saída do ventrículo esquerdo (VE) > 50 mmHg, apesar de terapia médica otimizada. 

Em pacientes com CMH obstrutiva sintomáticos, nos quais a terapia de redução septal é uma opção, a substituição valvar mitral deve ser considerada como opção para aliviar a via de saída do ventrículo esquerdo. 

Na escolha entre miectomia ou alcoolização septal, septo > 30 mm, gradiente de via de saída do ventrículo esquerdo (VSVE) < 100 mmHg e obstrução médio-apical são aspectos que favorecem a escolha da alcoolização septal. 

Aproximadamente 20% dos pacientes submetidos à miectomia septal na CMH evoluem com necessidade de marca-passo por bloqueio do nó atrioventricular. 

Em pacientes com CMH obstrutiva assintomáticos com capacidade normal ao exercício, a terapia de redução septal está indicada.