No momento da aspiração pode ocorrer diminuição importante da saturação e, portanto, para realizar este procedimento recomenda-se utilizar uso de circuito aberto de aspiração.

A ventilação com oscilação de alta frequência deve ser a primeira escolha para ventilar o recém-nascido com hipertensão pulmonar persistente.

Para valores iniciais do volume corrente na ventilação com oscilação de alta frequência deve-se utilizar: 3,5 a 4,5 mL/Kg. 

Recomenda-se iniciar a ventilação no modo convencional, ajustar os parâmetros de ventilação pulmonar mecânica para manter PaO2 entre 50-70 mmHg, permitindo hipercapnia e deixando a PaCO2 entre 45 e 60 mmHg, desde que o pH esteja ≥ 7,20.

A ventilação com óxido nítrico pode ser uma opção de tratamento para recém-nascidos com hipertensão pulmonar persistente; seu uso está indicado em recém-nascidos com idade gestacional ≥ 28 semanas e plaquetas com número menor que 70.000 mm³ .