O princípio da autonomia define que, na relação médico-paciente, o paciente possui o direito de ser informado sobre seu estado de saúde, sobre detalhes do tratamento a ser prescrito e tem toda a liberdade de decidir se irá ou não se submeter ao tratamento determinado, devendo o médico optar pela melhor opção terapêutica se o paciente não puder decidir.