A divulgação de informações públicas pode enfrentar resistência por parte dos servidores, que veem a medida como uma ameaça ao controle interno das informações. Para superar isso, é necessário investir em programas de capacitação e conscientização sobre a importância da transparência para a democracia e a eficiência governamental. 

A complexidade técnica dos dados divulgados pode dificultar a compreensão dos cidadãos, limitando a participação informada. Este desafio pode ser mitigado através da criação de plataformas digitais interativas e didáticas que traduzam os dados técnicos em informações acessíveis. 

A falta de uniformidade nos formatos de dados entre diferentes órgãos públicos pode comprometer a eficiência da transparência. A padronização dos formatos de dados, aliada à interoperabilidade dos sistemas de informação, é essencial para garantir a comparabilidade e a utilização efetiva das informações divulgadas.

A transparência pode ser vista como um fator que retarda os processos administrativos devido à necessidade de revisão e aprovação dos dados antes da publicação. Isso pode ser mitigado pela implementação de fluxos de trabalho automatizados que assegurem a qualidade dos dados sem comprometer a celeridade dos processos.