A irrigação com hipoclorito de sódio é desnecessária para a eliminação do biofilme intracanal, pois a instrumentação mecânica é suficiente para a remoção da carga microbiana. 

As infecções endodônticas primárias são geralmente causadas por bactérias aeróbias facultativas, e os estreptococos do grupo viridans são os principais patógenos isolados. 

As infecções endodônticas secundárias são frequentemente associadas à persistência de microrganismos resistentes ao tratamento, como o Enterococcus faecalis, que possui elevada capacidade de sobrevivência em ambientes com pH ácido e nutrientes limitados.  

Os canais radiculares necróticos apresentam microbiota predominantemente aeróbia, devido à maior disponibilidade de oxigênio no interior do canal. 

A formação de biofilme intracanal é rara e está associada exclusivamente a casos de reinfecção pós-tratamento, de modo que não ocorre em infecções primárias.