O nitrogênio é um elemento indispensável para o crescimento das algas, podendo, por isso, em certas condições, conduzir ao fenômeno da eutrofização.

O nitrogênio, nos processos de conversão da amônia em nitrito e, em seguida, do nitrito em nitrato (nitrificação), implica no consumo de oxigênio dissolvido no corpo d'água.

O nitrogênio, na forma de amônia livre, é diretamente tóxico aos peixes.

O nitrogênio é um elemento indispensável para o crescimento dos microrganismos responsáveis pelo tratamento do esgoto.

A determinação da forma predominante do nitrogênio pode fornecer indicações sobre o estágio da poluição eventualmente ocasionada por algum lançamento de esgoto a montante. Se esta poluição é recente, o nitrogênio estará na forma de nitrato e, se antiga, basicamente na forma de nitrogênio orgânico ou amônia.