A Doença de Bowen (PeIN basalóide) e a Eritroplasia de Queyrat (PeIN basalóide na glande) são lesões associadas ao HPV de baixo risco (tipos 6 e 11) e raramente progridem. 

Todas as lesões de PeIN (incluindo Doença de Bowen e Eritroplasia de Queyrat) são histogeneticamente idênticas e resultam da infecção pelo HPV tipo 16, sendo a única diferença sua localização anatômica.

A Papulose Bowenoide é uma PeIN associada ao Papilomavírus Humano (HPV), que se apresenta como pápulas múltiplas, e invariavelmente progride para carcinoma invasivo, exigindo penectomia. 

A PeIN diferenciada é o subtipo mais comum de PeIN (não associada ao HPV), frequentemente associada ao líquen escleroso, e tem maior potencial de progressão para carcinoma espinocelular invasivo do que a PeIN basalóide/verrucosa (associada ao HPV).