Mesmo após a aquisição da estabilidade, o servidor público poderá perder seu cargo. Uma hipótese é a perda decorrente de sentença judicial transitada em julgado. 

Invalidada por sentença judicial a demissão do servidor estável, será ele reintegrado, e o eventual ocupante da vaga, se estável, reconduzido ao cargo de origem, sem direito a indenização, aproveitado em outro cargo ou posto em disponibilidade com remuneração proporcional ao tempo de serviço.

A Emenda Constitucional nº 19, de 1998, incluiu a avaliação especial de desempenho, realizada por comissão instituída para essa finalidade, como condição obrigatória para a aquisição da estabilidade. Porém tal obrigatoriedade foi revogada em 2020, de modo que basta o transcurso do período de 3 anos do estágio probatório, para aquisição do direito à estabilidade. 

Extinto o cargo ou declarada a sua desnecessidade, o servidor estável ficará em disponibilidade, com remuneração proporcional ao tempo de serviço, até seu adequado aproveitamento em outro cargo.