A castanheira-do-brasil é afetada pelo Aspergillus flavus, que apesar de produzir substâncias atóxicas, altera o sabor, o odor e o aspecto das amêndoas.

No cacaueiro, a vassoura-de-bruxa, cujo sintoma típico é o superbrotamento em mudas e plantas adultas, reduz drasticamente a produção de frutos, podendo causar perdas totais.

Entre as medidas profiláticas recomendadas para o controle da murcha bacteriana da bananeira está o uso de variedades com brácteas caducas, como banana-prata-anã, banana-nanica e banana-da-terra, que são mais resistentes. 

A fusariose causa grandes prejuízos na pupunheira, sendo recomendado o uso de fungicidas sistêmicos por apresentarem alta eficiência no controle dessa doença.

Evitar ferimentos durante os tratos culturais e tratar os ramos afetados em plantas doentes estão entre as medidas adotadas no manejo da morte progressiva do cupuaçuzeiro.