A montagem de genomas complexos representa ainda
um dos desafios mais intricados da Bioinformática. As sequências repetidas, em particular, fornecem uma dificuldade
notável, pois essas podem confundir algoritmos de montagem, resultando em diversas e múltiplas possibilidades.
Para mitigar esse problema e alcançar a montagem correta,
a estratégia mais eficaz seria:

Question

A montagem de genomas complexos representa ainda
um dos desafios mais intricados da Bioinformática. As sequências repetidas, em particular, fornecem uma dificuldade
notável, pois essas podem confundir algoritmos de montagem, resultando em diversas e múltiplas possibilidades.
Para mitigar esse problema e alcançar a montagem correta,
a estratégia mais eficaz seria: Alternativa A: empregar técnicas de bioinformática estrutural para
analisar a conformação tridimensional do DNA e resolver as repetições.  Ou Alternativa B: melhorar as heurísticas que percorrem o grafo de
montagem, permitindo distinguir entre caminhos que
representam repetições reais e artefatos. Ou Alternativa C: aumentar a cobertura de sequenciamento, garantindo
que as repetições possam ser atravessadas várias
vezes para confirmar sua presença e posição. Ou Alternativa D: utilizar informações de mapeamento de leituras contra
um genoma de referência para desambiguar as regiões
repetitivas. Ou Alternativa E: sequenciar leituras que são longas o suficiente para
englobar a região repetida inteira ou de modo que cada
repetição tenha sua própria variante única.

Fundação Oswaldo Cruz · Accepted Answer

Alternativa [E] sequenciar leituras que são longas o suficiente para
englobar a região repetida inteira ou de modo que cada
repetição tenha sua própria variante única.

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A montagem de genomas complexos representa ainda um dos des...

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