No sistema operacional Linux, a interface shell permite
tanto executar programas distribuídos com o sistema operacional como desenvolver programas customizados. O
comando shell, que permite iterar todos os arquivos fastq
no diretório atual e mapeá-los no banco de dados denominado “referencia”, o qual contém o genoma de referência
indexado, também no diretório atual, produzindo arquivos
.sam como saída, é:

Question

No sistema operacional Linux, a interface shell permite
tanto executar programas distribuídos com o sistema operacional como desenvolver programas customizados. O
comando shell, que permite iterar todos os arquivos fastq
no diretório atual e mapeá-los no banco de dados denominado “referencia”, o qual contém o genoma de referência
indexado, também no diretório atual, produzindo arquivos
.sam como saída, é: Alternativa A: ls *.fastq | bwa mem referencia *fastq > *.sam Ou Alternativa B: grep *.fastq | bwa mem referencia *fastq > *.sam Ou Alternativa C: find *.fastq | bwa mem referencia *fastq > *.sam Ou Alternativa D: search for *.fastq | bwa mem referencia *fastq > *.sam Ou Alternativa E: for i in `ls *.fastq`; do bwa mem referencia $i > ${i/.
fastq/.sam}; done

Fundação Oswaldo Cruz · Accepted Answer

Alternativa [E] for i in `ls *.fastq`; do bwa mem referencia $i > ${i/.
fastq/.sam}; done

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No sistema operacional Linux, a interface shell permite tan...

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