A saída de água dos aquíferos, onde a água subterrânea aflora e flui em superfície para os corpos hídricos superficiais, não é significativa. Portanto, não influencia no equilíbrio das condições favoráveis à vida das espécies animais e vegetais.

As águas subterrâneas não têm nenhuma relação com as águas superficiais, portanto apresentam seu próprio ciclo hidrológico.

A água subterrânea apresenta alterações bruscas de temperatura ou nas suas qualidades físico-químicas, gerando um habitat instável para plantas aquáticas e animais sobreviverem.

A saída de água dos aquíferos, onde a água subterrânea aflora e flui em superfície, é imprescindível para manter lagoas costeiras e manguezais, pois permite diluir a salinidade das influências marinhas, distribuir nutrientes e regular as condições físico-químicas.

O aporte de água dos aquíferos não é fundamental para a manutenção dos ecossistemas.