O protocolo FTP é baseado no protocolo de transporte TCP, enquanto o protocolo HTTP é baseado no protocolo UDP.

O protocolo FTP estabelece duas conexões TCP paralelas: uma para controle e outra para envio de dados e, por outro lado, o HTTP estabelece apenas uma conexão, utilizando a mesma para ambas as funções.

O protocolo HTTP precisa manter informações de estado durante suas conexões (inclusive para acompanhar eventuais mudanças nos conteúdos dos objetos armazenados em um servidor WEB), enquanto o protocolo FTP não precisa se preocupar com isso, já que realiza apenas transferências de arquivo.

O protocolo HTTP utiliza, para seus comandos, o formato ASCII, permitindo sua leitura e sua interpretação por qualquer pessoa que tenha acesso ao seu conteúdo, enquanto o FTP utiliza códigos binários específicos, que precisam ser decodificados por um usuário especializado para que possam ser entendidos.

No protocolo FTP, para cada comando encaminhado, é tipicamente encaminhada uma resposta correspondente; já, no HTTP, não são encaminhadas respostas, e sim apenas os arquivos solicitados, sem qualquer informação adicional.