O Pneumocystis foi descoberto por Carlos Chagas em 1909. Sua importância clínica, no entanto, passou a ser observada somente a partir da década de 1940, com casos de pneumonia intersticial em indivíduos imunossuprimidos.
A partir da pandemia de HIV, na década de 1980, esse fungo ganhou destaque no meio médico, mantendo-se até hoje como a principal infecção oportunista nessa população.
Em pacientes vivendo com HIV com formas graves de pneumocistose (definidos como PaO2 < 70 mmHg em gasometria arterial), é primeira linha do tratamento a associação de