Em recém-nascidos, apresenta-se geralmente como um quadro séptico, com manifestações inespecíficas como insuficiente ganho de peso, anorexia, vômitos, dificuldade de sucção, irritabilidade, hipoatividade, convulsões, pele acinzentada e hipotermia.

Nos lactentes, a febre nunca está sozinha, sempre acompanhada de náuseas e vômitos, sendo esta a principal manifestação da ITU. 

Considera-se piúria a presença de 1 ou mais piócitos por campo microscópico.

Tanto em lactentes como em pré-escolares, sempre haverá sinais ou sintomas ligados ao trato urinário, como polaciúria, gotejamento urinário, disúria, urina com odor fétido, dor abdominal ou lombar.