O Sinan é um sistema de uso exclusivo do Ministério da Saúde, não sendo permitida a inclusão de agravos adicionais por estados e municípios, pois isso comprometeria a padronização nacional. 

O Sinan é alimentado pela notificação e investigação de doenças e agravos constantes na lista nacional de notificação compulsória, sendo vedado incluir doenças regionais, como a difilobotríase no município de São Paulo.

O Sinan é um sistema que permite a realização do diagnóstico dinâmico da ocorrência de um evento na população, podendo fornecer subsídios para explicações causais dos agravos de notificação compulsória, além de vir a indicar riscos aos quais as pessoas estão sujeitas, contribuindo assim, para a identificação da realidade epidemiológica de determinada área geográfica.

O Sinan é uma ferramenta utilizada apenas de forma centralizada, de modo que os dados gerados ficam restritos aos gestores federais, não havendo acesso para profissionais da rede local de saúde.