A principal via de transmissão para humanos é a vetorial, através das fezes de insetos triatomíneos, conhecidos popularmente como "barbeiros", que se infectam ao sugar o sangue de animais reservatórios, como gambás e tatus.

A fase crônica da doença pode ser assintomática, mas em uma parcela dos pacientes pode evoluir com manifestações graves, principalmente a cardiomiopatia chagásica e a megacólon/megaesôfago.

A transmissão vertical (mãe para filho durante a gestação ou parto), transfusional (através de sangue ou hemoderivados contaminados) e oral (por ingestão de alimentos contaminados, como caldo de cana ou açaí) são vias de infecção secundárias, porém relevantes.

O diagnóstico na fase crônica é predominantemente clínico, sendo a identificação do parasita no sangue por meio de exame direto (método de Giemsa) o principal método laboratorial confirmatório.