As perfurações próximas ao ápice apresentam pior prognóstico.

Uma perfuração intraóssea localizada no terço cervical pode ser tratada com extrusão dentária.

Nas perfurações intraósseas laterais, ocorridas durante a instrumentação do canal, o selamento deve ser realizado após 60 dias.

Quando a perfuração ocorrer em razão de sobreinstrumentação com alargamento acentuado do forame apical, o tratamento consiste na determinação do novo comprimento de trabalho, um pouco além do ápice, onde o cone principal será travado.