A contagem de células que é realizada rotineiramente no LCR é a contagem de glóbulos brancos e de glóbulos vermelhos. Qualquer uma delas deve ser realizada imediatamente, porque os GBs e Gvs começam a lisar em uma hora.

É essencial que o LCR seja enviado fresco para o laboratório de citologia, uma vez que as células começam a se desintegrar rapidamente. 

Existem diversos métodos de preparo, inclusive sedimentação, uso de filtro Millipore e citocentrifugação. Porém, é importante que esta seja bem rápido, uma vez que a velocidade distorce e rompe as células. A amostra deve ser centrifugada de 1 a 5 minutos, o fluido sobrenadante é retirado para ensaios adicionais, e lâminas são feitas a partir do sedimento. 

As preferências de fixação e coloração também variam, sendo empregados o Papanicolau, o Wright, além do May-Grunwald-Giemsa. 

As células encontradas no líquor normal são, principalmente, linfócitos e monócitos. O adulto geralmente, tem predominância de linfócitos sobre os monócitos.