Passados os primeiros 14 dias da doença, cerca de 90% dos pacientes evoluem para a forma subaguda, com predomínio dos sintomas articulares. 

Comumente apresenta padrão assimétrico e monoarticular, na maioria das vezes, de caráter incapacitante.

Entre os fatores reconhecidos como associados com a persistência dos sintomas musculoesqueléticos, estão: sexo masculino, idade acima de 40 anos, pouco envolvimento articular na fase aguda e diabetes mellitus.

Dos pacientes que evoluem para a fase crônica, cerca de 40% apresenta padrão inflamatório. Geralmente, o quadro é poliarticular, aditivo, simétrico e intermitente, associado ou não à rigidez matinal.

A maioria dos pacientes que cronificam apresentam manifestações musculoesqueléticas localizadas ou difusas com padrão não inflamatório. Os sintomas mais frequentes são dor articular, mialgia, fadiga, cefaleia, rigidez, depressão, transtornos do humor e distúrbios do sono.