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Um pesquisador está investigando o uso de ferramentas de
bioinformática para otimizar a edição genética via CRISPR/Cas9
em células humanas. Ele utiliza dados transcriptômicos (RNA-seq)
e simulações de dinâmica molecular para prever off-targets. Além
disso, o pesquisador aplica algoritmos de machine learning para
modelar a eficiência de guias de RNA (sgRNAs).
Tendo em vista a situação hipotética apresentada, julgue o item subsequente.
Modelos de machine learning que integram dados genômicos, transcriptômicos e epigenômicos são usados para prever eficiência de sgRNAs.
Um pesquisador está investigando o uso de ferramentas de
bioinformática para otimizar a edição genética via CRISPR/Cas9
em células humanas. Ele utiliza dados transcriptômicos (RNA-seq)
e simulações de dinâmica molecular para prever off-targets. Além
disso, o pesquisador aplica algoritmos de machine learning para
modelar a eficiência de guias de RNA (sgRNAs).
Tendo em vista a situação hipotética apresentada, julgue o item subsequente.
O alinhamento de sequências via BLAST é irrelevante para identificar regiões homólogas que possam causar off-targets no CRISPR.
Um pesquisador está investigando o uso de ferramentas de
bioinformática para otimizar a edição genética via CRISPR/Cas9
em células humanas. Ele utiliza dados transcriptômicos (RNA-seq)
e simulações de dinâmica molecular para prever off-targets. Além
disso, o pesquisador aplica algoritmos de machine learning para
modelar a eficiência de guias de RNA (sgRNAs).
Tendo em vista a situação hipotética apresentada, julgue o item subsequente.
O uso de biologia sintética pode tornar os sistemas CRISPR mais seguros.
Determinado projeto de pesquisa prevê análises
transcriptômica, metabolômica e proteômica de uma espécie de
organismos unicelulares, bem como a caracterização
metagenômica do ambiente de ocorrência natural dessa espécie.
Durante o preparo para as análises, as células foram mantidas em
duas condições diferentes, denominadas A e B. O estudo
morfológico dos microrganismos mostrou que o tamanho celular
médio é de 15 µm, com células nucleadas e elevada
complexidade de organelas citoplasmáticas.
Considerando as informações precedentes, julgue o item que se segue.
O aumento da abundância de um transcrito na condição A, em relação a B, e a diminuição da abundância da proteína correspondente à tradução do mesmo transcrito indicam seguramente a ocorrência de erro experimental.
Determinado projeto de pesquisa prevê análises
transcriptômica, metabolômica e proteômica de uma espécie de
organismos unicelulares, bem como a caracterização
metagenômica do ambiente de ocorrência natural dessa espécie.
Durante o preparo para as análises, as células foram mantidas em
duas condições diferentes, denominadas A e B. O estudo
morfológico dos microrganismos mostrou que o tamanho celular
médio é de 15 µm, com células nucleadas e elevada
complexidade de organelas citoplasmáticas.
Considerando as informações precedentes, julgue o item que se segue.
Na situação apresentada, a análise por citometria de fluxo que mostre fluorescência após exposição a 1,2,3-dihidrorodamina pode ser consequente à presença de espécies reativas de oxigênio intracelulares.
Determinado projeto de pesquisa prevê análises
transcriptômica, metabolômica e proteômica de uma espécie de
organismos unicelulares, bem como a caracterização
metagenômica do ambiente de ocorrência natural dessa espécie.
Durante o preparo para as análises, as células foram mantidas em
duas condições diferentes, denominadas A e B. O estudo
morfológico dos microrganismos mostrou que o tamanho celular
médio é de 15 µm, com células nucleadas e elevada
complexidade de organelas citoplasmáticas.
Considerando as informações precedentes, julgue o item que se segue.
Microarrays são a principal ferramenta para análise de dados metagenômicos.
Determinado projeto de pesquisa prevê análises
transcriptômica, metabolômica e proteômica de uma espécie de
organismos unicelulares, bem como a caracterização
metagenômica do ambiente de ocorrência natural dessa espécie.
Durante o preparo para as análises, as células foram mantidas em
duas condições diferentes, denominadas A e B. O estudo
morfológico dos microrganismos mostrou que o tamanho celular
médio é de 15 µm, com células nucleadas e elevada
complexidade de organelas citoplasmáticas.
Considerando as informações precedentes, julgue o item que se segue.
A detecção de modificações pós-traducionais em enzimas regulatórias pode elucidar possíveis diferenças nas abundâncias de metabólitos, mesmo que as abundâncias das enzimas não estejam alteradas.
Em um estudo comparativo entre uma planta nativa (espécie A) e uma geneticamente modificada a partir da espécie A, com deleção de um único gene, foi realizada uma análise proteômica compartiva por LC-MS/MS. O banco de dados utilizado para a identificação de proteínas continha todas as sequências conhecidas da família taxonômica da espécie A.
A partir dessa situação hipotética, julgue o item a seguir.
Se a abordagem utilizada for do tipo SRM (selected reaction monitoring), será feito o monitoramento de transições predefinidas de íons, adequado para a validação de alvos específicos identificados previamente.
Em um estudo comparativo entre uma planta nativa (espécie A) e uma geneticamente modificada a partir da espécie A, com deleção de um único gene, foi realizada uma análise proteômica compartiva por LC-MS/MS. O banco de dados utilizado para a identificação de proteínas continha todas as sequências conhecidas da família taxonômica da espécie A.
A partir dessa situação hipotética, julgue o item a seguir.
A quantificação de proteínas no referido estudo depende da comparação da massa molecular da soma dos íons detectados e da massa molecular da proteína presente no banco de dados.
Em um estudo comparativo entre uma planta nativa (espécie A) e uma geneticamente modificada a partir da espécie A, com deleção de um único gene, foi realizada uma análise proteômica compartiva por LC-MS/MS. O banco de dados utilizado para a identificação de proteínas continha todas as sequências conhecidas da família taxonômica da espécie A.
A partir dessa situação hipotética, julgue o item a seguir.
Espera-se encontrar sequências redundantes no banco de dados utilizado.
Em um estudo comparativo entre uma planta nativa (espécie A) e uma geneticamente modificada a partir da espécie A, com deleção de um único gene, foi realizada uma análise proteômica compartiva por LC-MS/MS. O banco de dados utilizado para a identificação de proteínas continha todas as sequências conhecidas da família taxonômica da espécie A.
A partir dessa situação hipotética, julgue o item a seguir.
Na situação em questão, espera-se encontrar diferença de abundância em uma única proteína, na análise proteômica de descoberta.
Julgue o próximo item, pertinente à utilização de recursos genéticos.
O conceito moderno de recursos genéticos se refere às espécies animais, vegetais e microbianas, aquáticas e terrestres, que foram desenvolvidas e melhoradas e que têm apenas valor econômico e científico em um país.
Julgue o item que se segue, pertinente a genética molecular.
A genética molecular pode ser utilizada para fazer que genes estranhos sejam expressos em bactérias e leveduras ou mesmo em outras células superiores.
A respeito da conservação de recursos genéticos de origem animal, julgue o item a seguir.
A conservação in situ é recomendada em unidades de conservação de proteção integral, pois facilita o processo de evolução e de adaptação contínua de uma espécie.
Tendo o texto precedente como referência inicial, julgue o próximo item, relativo ao ensaio ATAC-Seq.
O ensaio ATAC-Seq permite identificar sequências de DNA localizadas na região adjacente à extremidade 5' do gene, antes da região codificante.
Tendo o texto precedente como referência inicial, julgue o próximo item, relativo ao ensaio ATAC-Seq.
O perfil de acessibilidade da cromatina traduz a disponibilidade de um trecho de DNA para reguladores de expressão gênica.
Tendo o texto precedente como referência inicial, julgue o próximo item, relativo ao ensaio ATAC-Seq.
A reação de amplificação citada no texto em questão é repetida ciclicamente por meio de uma série de alterações de temperatura, o que possibilita a produção de muitas cópias de fragmentos específicos de DNA.
Em células diferenciadas, a cromatina é espacialmente segregada em regiões cromossômicas. Durante a interfase, é possível observar duas configurações diferentes da cromatina, a eucromatina e a heterocromatina, duas formas estrutural e funcionalmente distinguíveis. A heterocromatina é categorizada em heterocromatina facultativa e constitutiva.
Acerca das duas formas estrutural e funcionalmente distinguíveis da cromatina, julgue o item subsequente.
Em células diferenciadas, a eucromatina consiste em domínios transcricionalmente silenciosos, o que permite que elementos genéticos móveis sejam transcritos.
Em células diferenciadas, a cromatina é espacialmente segregada em regiões cromossômicas. Durante a interfase, é possível observar duas configurações diferentes da cromatina, a eucromatina e a heterocromatina, duas formas estrutural e funcionalmente distinguíveis. A heterocromatina é categorizada em heterocromatina facultativa e constitutiva.
Acerca das duas formas estrutural e funcionalmente distinguíveis da cromatina, julgue o item subsequente.
A heterocromatina, constitutiva ou facultativa, abrange as mesmas regiões genômicas nos diferentes tipos celulares.
Procedimentos capazes de realizar alterações no genoma
têm sido desenvolvidos desde a década de noventa do século
passado.
A repetição palindrômica curta regularmente
interespaçada em cluster (CRISPR), geralmente denominado de
RNA guia, e a proteína (Cas-9) associada a ela constituem o
sistema CRISPR/Cas9. O sistema CRISPR/Cas9 é considerado o
sistema mais eficaz de edição de gênica. Ele baseia-se na
capacidade das enzimas Cas de cortar um fragmento de DNA
específico quando associadas a um RNA de reconhecimento
adequado, um RNA guia. Outro sistema de edição gênica foi
relatado em dois estudos publicados em 2024 na revista Nature.
Esse novo sistema consiste em uma recombinase, derivada de
elementos conhecidos como genes saltadores, conectada a um
RNA guia, que se liga fisicamente, ou faz a ponte, entre duas
sequências de DNA. Os autores denominaram esse mecanismo de
edição gênica de edição ponte.
Tendo em vista os sistemas de edição gênica relatados no texto precedente, julgue o item a seguir.
A proteína Cas-9 na ausência do RNA guia cliva ligações N-glicosídicas entre as bases nitrogenadas, promovendo no DNA quebras de fita simples.
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