Questões de Concurso
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Julgue o próximo item, pertinentes ao uso das ferramentas da informática nas pesquisas científicas em biotecnologia.
As diretrizes FAIR (findability, accessibility, interoperability, and reusability) foram delineadas para promover o reúso de dados científicos, como a designação de identificadores únicos e persistentes não só para os arquivos de dados, mas também para metadados, que devem descrever a procedência e natureza dos dados.
Julgue o próximo item, pertinentes ao uso das ferramentas da informática nas pesquisas científicas em biotecnologia.
O gerenciador de pacotes “conda” pode ser utilizado para todos os sistemas operacionais, ao passo que o bioconda, que não suporta o sistema operacional Windows nativamente, consiste em um projeto que estende os pacotes do conda com milhares de programas utilizados na bioinformática, como o NCBI BLAST.
Julgue o próximo item, pertinentes ao uso das ferramentas da informática nas pesquisas científicas em biotecnologia.
O projeto Bioconductor fornece um ecossistema de software livre, baseado na linguagem Python, e um grande repositório de métodos estatísticos e gráficos para análise de dados genômicos e de diversas outras técnicas “ômicas”.
Julgue o próximo item, pertinentes ao uso das ferramentas da informática nas pesquisas científicas em biotecnologia.
A transformada de Burrows-Wheeler foi originalmente concebida para auxiliar na compressão de dados e, na bioinformática, foi adaptada como base algorítmica central para diversos programas de montagem de genomas e metagenomas.
Na avaliação das propriedades de uma enzima obtida em
laboratório (chamada de enzima X), notou-se que sua atividade
catalítica aumentava progressivamente com o aumento de
temperatura entre 20 °C e 50 °C, mas que era perdida
subitamente a 60 °C. Em outro teste, notou-se que a adição de um
inibidor era capaz de aumentar a constante Km, mas não diminuir
a
velocidade máxima da reação catalisada pela enzima X.
Observou-se, também, que a inibição de uma proteína quinase no
organismo que gera a enzima X levava a um aumento da
atividade dessa enzima. Essa proteína quinase inibida tem como
substrato a enzima X.
Considerando as informações precedentes, julgue o item subsequente.
A enzima em questão tem temperatura ótima de 50 °C.
Na avaliação das propriedades de uma enzima obtida em
laboratório (chamada de enzima X), notou-se que sua atividade
catalítica aumentava progressivamente com o aumento de
temperatura entre 20 °C e 50 °C, mas que era perdida
subitamente a 60 °C. Em outro teste, notou-se que a adição de um
inibidor era capaz de aumentar a constante Km, mas não diminuir
a
velocidade máxima da reação catalisada pela enzima X.
Observou-se, também, que a inibição de uma proteína quinase no
organismo que gera a enzima X levava a um aumento da
atividade dessa enzima. Essa proteína quinase inibida tem como
substrato a enzima X.
Considerando as informações precedentes, julgue o item subsequente.
Nessa situação hipotética, a inibição é do tipo competitiva, reversível.
Na avaliação das propriedades de uma enzima obtida em
laboratório (chamada de enzima X), notou-se que sua atividade
catalítica aumentava progressivamente com o aumento de
temperatura entre 20 °C e 50 °C, mas que era perdida
subitamente a 60 °C. Em outro teste, notou-se que a adição de um
inibidor era capaz de aumentar a constante Km, mas não diminuir
a
velocidade máxima da reação catalisada pela enzima X.
Observou-se, também, que a inibição de uma proteína quinase no
organismo que gera a enzima X levava a um aumento da
atividade dessa enzima. Essa proteína quinase inibida tem como
substrato a enzima X.
Considerando as informações precedentes, julgue o item subsequente.
No contexto analisado, a fosforilação da enzima X inibe sua atividade.
Em um projeto de prospecção de fungos com o objetivo
de produção enzimática, obteve-se uma condição de cultivo
adequada ao aumento de secreção da enzima de interesse. Foram
utilizados métodos de análise para identificação e quantificação
de tal enzima no meio de cultivo. A identificação foi feita por
digestão da enzima e sequenciamento dos peptídios, mediante
espectrometria de massa. A massa molecular média da enzima foi
determinada como 55 kDa.
Considerando essa situação hipotética, julgue o próximo item.
A injeção de uma mistura de peptídios trípticos dessa enzima, em um sistema cromatográfico de fase reversa acoplado a um espectrômetro de massa com analisadores do tipo quadrupolo e tempo de voo, fornece dados suficientes para a identificação da enzima em um banco de dados.
Em um projeto de prospecção de fungos com o objetivo
de produção enzimática, obteve-se uma condição de cultivo
adequada ao aumento de secreção da enzima de interesse. Foram
utilizados métodos de análise para identificação e quantificação
de tal enzima no meio de cultivo. A identificação foi feita por
digestão da enzima e sequenciamento dos peptídios, mediante
espectrometria de massa. A massa molecular média da enzima foi
determinada como 55 kDa.
Considerando essa situação hipotética, julgue o próximo item.
Apesar de nem sempre ser diretamente acoplada à cromatografia, a espectrometria de massa com ionização por desorção a laser é suficiente para a determinação de massa molecular da enzima, como a descrita na situação em análise.
Em um projeto de prospecção de fungos com o objetivo
de produção enzimática, obteve-se uma condição de cultivo
adequada ao aumento de secreção da enzima de interesse. Foram
utilizados métodos de análise para identificação e quantificação
de tal enzima no meio de cultivo. A identificação foi feita por
digestão da enzima e sequenciamento dos peptídios, mediante
espectrometria de massa. A massa molecular média da enzima foi
determinada como 55 kDa.
Considerando essa situação hipotética, julgue o próximo item.
A digestão da enzima para identificação por LCMS deve ser feita utilizando-se aminopeptidase, que é vantajosa em relação a outras proteases por produzir a grande maioria dos peptídios com radicais polares no C-terminal.
Um projeto de pesquisa visa à extração e à purificação de
uma enzima com atividade proteolítica a partir de 20 kg de um
extrato vegetal, de forma a preservar a atividade enzimática até o
final do processo, pois a enzima se desnatura facilmente.
Espera-se, com isso, extrair cerca de 20 microgramas da enzima
purificada e ativa em cada lote de material processado, que tenha
sido
considerado
material
suficiente
para
posteriores
caracterizações estruturais e funcionais da enzima.
Considerando essa situação hipotética, julgue o item a seguir.
É recomendado o uso de inibidores reversíveis de proteases durante o processo de extração e purificação.
Um projeto de pesquisa visa à extração e à purificação de
uma enzima com atividade proteolítica a partir de 20 kg de um
extrato vegetal, de forma a preservar a atividade enzimática até o
final do processo, pois a enzima se desnatura facilmente.
Espera-se, com isso, extrair cerca de 20 microgramas da enzima
purificada e ativa em cada lote de material processado, que tenha
sido
considerado
material
suficiente
para
posteriores
caracterizações estruturais e funcionais da enzima.
Considerando essa situação hipotética, julgue o item a seguir.
O uso de eletroforese em gel de poliacrilamida e dodecil sulfato de sódio é adequado à purificação desejada.
Um projeto de pesquisa visa à extração e à purificação de
uma enzima com atividade proteolítica a partir de 20 kg de um
extrato vegetal, de forma a preservar a atividade enzimática até o
final do processo, pois a enzima se desnatura facilmente.
Espera-se, com isso, extrair cerca de 20 microgramas da enzima
purificada e ativa em cada lote de material processado, que tenha
sido
considerado
material
suficiente
para
posteriores
caracterizações estruturais e funcionais da enzima.
Considerando essa situação hipotética, julgue o item a seguir.
Se for usada cromatografia de exclusão molecular, deve-se separar o extrato da resina por centrifugação branda, mantendo-se a fração ativa no sobrenadante.
Um projeto de pesquisa visa à extração e à purificação de
uma enzima com atividade proteolítica a partir de 20 kg de um
extrato vegetal, de forma a preservar a atividade enzimática até o
final do processo, pois a enzima se desnatura facilmente.
Espera-se, com isso, extrair cerca de 20 microgramas da enzima
purificada e ativa em cada lote de material processado, que tenha
sido
considerado
material
suficiente
para
posteriores
caracterizações estruturais e funcionais da enzima.
Considerando essa situação hipotética, julgue o item a seguir.
Por se tratar de um extrato vegetal natural, é dispensável o uso de equipamento de proteção individual (EPI) em sua manipulação inicial.
Um projeto de pesquisa visa à extração e à purificação de
uma enzima com atividade proteolítica a partir de 20 kg de um
extrato vegetal, de forma a preservar a atividade enzimática até o
final do processo, pois a enzima se desnatura facilmente.
Espera-se, com isso, extrair cerca de 20 microgramas da enzima
purificada e ativa em cada lote de material processado, que tenha
sido
considerado
material
suficiente
para
posteriores
caracterizações estruturais e funcionais da enzima.
Considerando essa situação hipotética, julgue o item a seguir.
A cromatografia de troca iônica é adequada ao processo de purificação e separará a enzima de outros componentes com base em sua carga líquida em uma solução.
Um projeto de pesquisa visa à extração e à purificação de
uma enzima com atividade proteolítica a partir de 20 kg de um
extrato vegetal, de forma a preservar a atividade enzimática até o
final do processo, pois a enzima se desnatura facilmente.
Espera-se, com isso, extrair cerca de 20 microgramas da enzima
purificada e ativa em cada lote de material processado, que tenha
sido
considerado
material
suficiente
para
posteriores
caracterizações estruturais e funcionais da enzima.
Considerando essa situação hipotética, julgue o item a seguir.
A pesagem do material, desde a etapa inicial até o produto final, deve ser feita na mesma balança analítica, devidamente limpa e protegida a cada etapa.
Julgue o item subsecutivo, em relação às técnicas ômicas aplicadas na avaliação da regulação de expressão gênica e ao fluxo da informação genética.
Além das avaliações globais da expressão gênica, é possível, também, avaliar os níveis de metabólitos totais e específicos, bem como rastreá-los em seus diferentes caminhos por meio da utilização de substratos marcados com carbono-13 (¹³C) e nitrogênio-15 (¹⁵N).
Julgue o item subsecutivo, em relação às técnicas ômicas aplicadas na avaliação da regulação de expressão gênica e ao fluxo da informação genética.
A especificidade das técnicas transcriptômicas é aumentada pela possibilidade de amplificação do material presente na amostra, com a consequente redução da sensibilidade proveniente dos erros inseridos no processo.
Julgue o item subsecutivo, em relação às técnicas ômicas aplicadas na avaliação da regulação de expressão gênica e ao fluxo da informação genética.
É possível proceder a análises de expressão gênica em metatranscriptomas microbianos, por RNAseq, sem genomas previamente montados.
Julgue o item subsecutivo, em relação às técnicas ômicas aplicadas na avaliação da regulação de expressão gênica e ao fluxo da informação genética.
Interatoma é um termo que designa especificamente as interações entre proteínas catalíticas e estruturais, estendendo-se às análises dessas associações pelas metodologias de metabolômica, proteômica e cristalografia.
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