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Julgue o próximo item, referente a técnicas de sequenciamento de DNA em escala e visualização e manipulação de estruturas de macromoléculas biológicas.
A celulose, um homopolissacarídeo composto por monômeros de celobiose, pode ser produzida por bactérias, entre as quais se destacam as do gênero Komagataeibacter, através da fermentação de meios ricos em carbono e nitrogênio, sendo denominada celulose bacteriana, que, diferentemente da celulose vegetal, não possui outras macromoléculas, como lignina e hemicelulose, ligadas às suas fibras.
O processo de anotação genômica requer o uso de fundamentos de biologia e diversas ferramentas para auxiliar o processo. A esse respeito, julgue o item a seguir.
Os programas de alinhamento múltiplo de sequências, como o MUSCLE, CLUSTAL W e MAFFT, fazem uso da estratégia de alinhamento progressivo,em que uma árvore-guia é gerada a partir de todas as combinações de alinhamentos par-a-par, e, posteriormente, alinham-se as duas mais similares de acordo com a pontuação fornecida por uma matriz de substituição selecionável pelo usuário.
Em relação às técnicas “ômicas”, julgue o item seguinte.
Nas análises transcriptômicas, é recomendado o uso de tecnologias PacBio e Oxford Nanopore para sequenciar moléculas de RNA diretamente (sem conversão para cDNA) e, também, identificar transcritos completos, devido ao tamanho das leituras geradas, o que permite resolver isoformas completas e eventos de poliadenilação alternativa dos transcritos.
Na avaliação das propriedades de uma enzima obtida em
laboratório (chamada de enzima X), notou-se que sua atividade
catalítica aumentava progressivamente com o aumento de
temperatura entre 20 °C e 50 °C, mas que era perdida
subitamente a 60 °C. Em outro teste, notou-se que a adição de um
inibidor era capaz de aumentar a constante Km, mas não diminuir
a
velocidade máxima da reação catalisada pela enzima X.
Observou-se, também, que a inibição de uma proteína quinase no
organismo que gera a enzima X levava a um aumento da
atividade dessa enzima. Essa proteína quinase inibida tem como
substrato a enzima X.
Considerando as informações precedentes, julgue o item subsequente.
A enzima em questão tem temperatura ótima de 50 °C.
Na avaliação das propriedades de uma enzima obtida em
laboratório (chamada de enzima X), notou-se que sua atividade
catalítica aumentava progressivamente com o aumento de
temperatura entre 20 °C e 50 °C, mas que era perdida
subitamente a 60 °C. Em outro teste, notou-se que a adição de um
inibidor era capaz de aumentar a constante Km, mas não diminuir
a
velocidade máxima da reação catalisada pela enzima X.
Observou-se, também, que a inibição de uma proteína quinase no
organismo que gera a enzima X levava a um aumento da
atividade dessa enzima. Essa proteína quinase inibida tem como
substrato a enzima X.
Considerando as informações precedentes, julgue o item subsequente.
Nessa situação hipotética, a inibição é do tipo competitiva, reversível.
Em um projeto de prospecção de fungos com o objetivo
de produção enzimática, obteve-se uma condição de cultivo
adequada ao aumento de secreção da enzima de interesse. Foram
utilizados métodos de análise para identificação e quantificação
de tal enzima no meio de cultivo. A identificação foi feita por
digestão da enzima e sequenciamento dos peptídios, mediante
espectrometria de massa. A massa molecular média da enzima foi
determinada como 55 kDa.
Considerando essa situação hipotética, julgue o próximo item.
A injeção de uma mistura de peptídios trípticos dessa enzima, em um sistema cromatográfico de fase reversa acoplado a um espectrômetro de massa com analisadores do tipo quadrupolo e tempo de voo, fornece dados suficientes para a identificação da enzima em um banco de dados.
Em um projeto de prospecção de fungos com o objetivo
de produção enzimática, obteve-se uma condição de cultivo
adequada ao aumento de secreção da enzima de interesse. Foram
utilizados métodos de análise para identificação e quantificação
de tal enzima no meio de cultivo. A identificação foi feita por
digestão da enzima e sequenciamento dos peptídios, mediante
espectrometria de massa. A massa molecular média da enzima foi
determinada como 55 kDa.
Considerando essa situação hipotética, julgue o próximo item.
Apesar de nem sempre ser diretamente acoplada à cromatografia, a espectrometria de massa com ionização por desorção a laser é suficiente para a determinação de massa molecular da enzima, como a descrita na situação em análise.
Em um projeto de prospecção de fungos com o objetivo
de produção enzimática, obteve-se uma condição de cultivo
adequada ao aumento de secreção da enzima de interesse. Foram
utilizados métodos de análise para identificação e quantificação
de tal enzima no meio de cultivo. A identificação foi feita por
digestão da enzima e sequenciamento dos peptídios, mediante
espectrometria de massa. A massa molecular média da enzima foi
determinada como 55 kDa.
Considerando essa situação hipotética, julgue o próximo item.
A digestão da enzima para identificação por LCMS deve ser feita utilizando-se aminopeptidase, que é vantajosa em relação a outras proteases por produzir a grande maioria dos peptídios com radicais polares no C-terminal.
Um projeto de pesquisa visa à extração e à purificação de
uma enzima com atividade proteolítica a partir de 20 kg de um
extrato vegetal, de forma a preservar a atividade enzimática até o
final do processo, pois a enzima se desnatura facilmente.
Espera-se, com isso, extrair cerca de 20 microgramas da enzima
purificada e ativa em cada lote de material processado, que tenha
sido
considerado
material
suficiente
para
posteriores
caracterizações estruturais e funcionais da enzima.
Considerando essa situação hipotética, julgue o item a seguir.
É recomendado o uso de inibidores reversíveis de proteases durante o processo de extração e purificação.
Um projeto de pesquisa visa à extração e à purificação de
uma enzima com atividade proteolítica a partir de 20 kg de um
extrato vegetal, de forma a preservar a atividade enzimática até o
final do processo, pois a enzima se desnatura facilmente.
Espera-se, com isso, extrair cerca de 20 microgramas da enzima
purificada e ativa em cada lote de material processado, que tenha
sido
considerado
material
suficiente
para
posteriores
caracterizações estruturais e funcionais da enzima.
Considerando essa situação hipotética, julgue o item a seguir.
O uso de eletroforese em gel de poliacrilamida e dodecil sulfato de sódio é adequado à purificação desejada.
Um projeto de pesquisa visa à extração e à purificação de
uma enzima com atividade proteolítica a partir de 20 kg de um
extrato vegetal, de forma a preservar a atividade enzimática até o
final do processo, pois a enzima se desnatura facilmente.
Espera-se, com isso, extrair cerca de 20 microgramas da enzima
purificada e ativa em cada lote de material processado, que tenha
sido
considerado
material
suficiente
para
posteriores
caracterizações estruturais e funcionais da enzima.
Considerando essa situação hipotética, julgue o item a seguir.
A cromatografia de troca iônica é adequada ao processo de purificação e separará a enzima de outros componentes com base em sua carga líquida em uma solução.
Julgue o item subsecutivo, em relação às técnicas ômicas aplicadas na avaliação da regulação de expressão gênica e ao fluxo da informação genética.
A especificidade das técnicas transcriptômicas é aumentada pela possibilidade de amplificação do material presente na amostra, com a consequente redução da sensibilidade proveniente dos erros inseridos no processo.
Julgue o item subsecutivo, em relação às técnicas ômicas aplicadas na avaliação da regulação de expressão gênica e ao fluxo da informação genética.
É possível proceder a análises de expressão gênica em metatranscriptomas microbianos, por RNAseq, sem genomas previamente montados.
Julgue o item subsequente, relacionados às metodologias de sequenciamento e análises de ácidos nucleicos.
A abordagem metagenômica contribui para a análise de microbiomas e para a prospecção de genes em diversos ambient es, ain da que sem a montagem completa dos genomas detectados, e, por ser a metagenômica uma abordagem independente de amplificação, a abundância microbiana não afeta a análise de diversidade.
Julgue o item subsequente, relacionados às metodologias de sequenciamento e análises de ácidos nucleicos.
Na análise de genes parálogos, a identidade das sequências, ou similaridade funcional, é alta, devido à especiação, ao passo que, em genes ortólogos, a similaridade é menor, em razão das duplicações gênicas no processo evolutivo.
Julgue o item subsequente, relacionados às metodologias de sequenciamento e análises de ácidos nucleicos.
A análise comparativa de mutações pontuais, como SNP e INDEL, pode ser aplicada para o rastreamento da dispersão de microrganismos, para a avaliação da diversidade genética e para o entendimento da evolução de adaptações e resistências.
Julgue o item a seguir, relativo a bioprocessos, obtenção de bioinsumos e processos fermentativos.
Degradação, conversão, ou assimilação de substratos em cultivos microbianos não dependem apenas de características intrínsecas aos substratos e às espécies microbianas, mas também de fatores extrínsecos, como a transferência de oxigênio e o sistema de agitação em um biorreator.
Julgue o item a seguir, relativo a bioprocessos, obtenção de bioinsumos e processos fermentativos.
Em processos de decomposição de biopolímeros, como em biorreatores anóxicos, aplicam-se culturas puras e compartimentalizadas de diferentes bactérias, pois a mistura e a competição interespécies são prejudiciais ao processo de decomposição.
Julgue o item a seguir, relativo a bioprocessos, obtenção de bioinsumos e processos fermentativos.
Em se tratando de enzimas como bioinsumos, é necessário avaliar a qualidade de diferentes produções (lotes) por meio da determinação da atividade específica da enzima, medida que indica o número de unidades internacionais da enzima por massa de bioinsumo purificado.
Julgue o item a seguir, relativo a bioprocessos, obtenção de bioinsumos e processos fermentativos.
Na fermentação etanólica em Saccharomyces cerevisiae, o equilíbrio redox é mantido com hexoses, como aceptores de elétrons, e ácidos orgânicos, como doadores de elétrons.
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