Questões de Concurso
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Em um estudo comparativo entre uma planta nativa (espécie A) e uma geneticamente modificada a partir da espécie A, com deleção de um único gene, foi realizada uma análise proteômica compartiva por LC-MS/MS. O banco de dados utilizado para a identificação de proteínas continha todas as sequências conhecidas da família taxonômica da espécie A.
A partir dessa situação hipotética, julgue o item a seguir.
Na situação em questão, espera-se encontrar diferença de abundância em uma única proteína, na análise proteômica de descoberta.
Julgue o próximo item, pertinente à utilização de recursos genéticos.
O conceito moderno de recursos genéticos se refere às espécies animais, vegetais e microbianas, aquáticas e terrestres, que foram desenvolvidas e melhoradas e que têm apenas valor econômico e científico em um país.
Julgue o item que se segue, pertinente a genética molecular.
A genética molecular pode ser utilizada para fazer que genes estranhos sejam expressos em bactérias e leveduras ou mesmo em outras células superiores.
A respeito da conservação de recursos genéticos de origem animal, julgue o item a seguir.
A conservação in situ é recomendada em unidades de conservação de proteção integral, pois facilita o processo de evolução e de adaptação contínua de uma espécie.
Tendo o texto precedente como referência inicial, julgue o próximo item, relativo ao ensaio ATAC-Seq.
O ensaio ATAC-Seq permite identificar sequências de DNA localizadas na região adjacente à extremidade 5' do gene, antes da região codificante.
Tendo o texto precedente como referência inicial, julgue o próximo item, relativo ao ensaio ATAC-Seq.
O perfil de acessibilidade da cromatina traduz a disponibilidade de um trecho de DNA para reguladores de expressão gênica.
Tendo o texto precedente como referência inicial, julgue o próximo item, relativo ao ensaio ATAC-Seq.
A reação de amplificação citada no texto em questão é repetida ciclicamente por meio de uma série de alterações de temperatura, o que possibilita a produção de muitas cópias de fragmentos específicos de DNA.
Em células diferenciadas, a cromatina é espacialmente segregada em regiões cromossômicas. Durante a interfase, é possível observar duas configurações diferentes da cromatina, a eucromatina e a heterocromatina, duas formas estrutural e funcionalmente distinguíveis. A heterocromatina é categorizada em heterocromatina facultativa e constitutiva.
Acerca das duas formas estrutural e funcionalmente distinguíveis da cromatina, julgue o item subsequente.
Em células diferenciadas, a eucromatina consiste em domínios transcricionalmente silenciosos, o que permite que elementos genéticos móveis sejam transcritos.
Em células diferenciadas, a cromatina é espacialmente segregada em regiões cromossômicas. Durante a interfase, é possível observar duas configurações diferentes da cromatina, a eucromatina e a heterocromatina, duas formas estrutural e funcionalmente distinguíveis. A heterocromatina é categorizada em heterocromatina facultativa e constitutiva.
Acerca das duas formas estrutural e funcionalmente distinguíveis da cromatina, julgue o item subsequente.
As regiões heterocromáticas de um cromossomo estão presentes apenas em células eucarióticas, enquanto as eucromáticas existem em células eucarióticas e procarióticas.
Em células diferenciadas, a cromatina é espacialmente segregada em regiões cromossômicas. Durante a interfase, é possível observar duas configurações diferentes da cromatina, a eucromatina e a heterocromatina, duas formas estrutural e funcionalmente distinguíveis. A heterocromatina é categorizada em heterocromatina facultativa e constitutiva.
Acerca das duas formas estrutural e funcionalmente distinguíveis da cromatina, julgue o item subsequente.
A heterocromatina, constitutiva ou facultativa, abrange as mesmas regiões genômicas nos diferentes tipos celulares.
Procedimentos capazes de realizar alterações no genoma
têm sido desenvolvidos desde a década de noventa do século
passado.
A repetição palindrômica curta regularmente
interespaçada em cluster (CRISPR), geralmente denominado de
RNA guia, e a proteína (Cas-9) associada a ela constituem o
sistema CRISPR/Cas9. O sistema CRISPR/Cas9 é considerado o
sistema mais eficaz de edição de gênica. Ele baseia-se na
capacidade das enzimas Cas de cortar um fragmento de DNA
específico quando associadas a um RNA de reconhecimento
adequado, um RNA guia. Outro sistema de edição gênica foi
relatado em dois estudos publicados em 2024 na revista Nature.
Esse novo sistema consiste em uma recombinase, derivada de
elementos conhecidos como genes saltadores, conectada a um
RNA guia, que se liga fisicamente, ou faz a ponte, entre duas
sequências de DNA. Os autores denominaram esse mecanismo de
edição gênica de edição ponte.
Tendo em vista os sistemas de edição gênica relatados no texto precedente, julgue o item a seguir.
A proteína Cas-9 na ausência do RNA guia cliva ligações N-glicosídicas entre as bases nitrogenadas, promovendo no DNA quebras de fita simples.
Procedimentos capazes de realizar alterações no genoma
têm sido desenvolvidos desde a década de noventa do século
passado.
A repetição palindrômica curta regularmente
interespaçada em cluster (CRISPR), geralmente denominado de
RNA guia, e a proteína (Cas-9) associada a ela constituem o
sistema CRISPR/Cas9. O sistema CRISPR/Cas9 é considerado o
sistema mais eficaz de edição de gênica. Ele baseia-se na
capacidade das enzimas Cas de cortar um fragmento de DNA
específico quando associadas a um RNA de reconhecimento
adequado, um RNA guia. Outro sistema de edição gênica foi
relatado em dois estudos publicados em 2024 na revista Nature.
Esse novo sistema consiste em uma recombinase, derivada de
elementos conhecidos como genes saltadores, conectada a um
RNA guia, que se liga fisicamente, ou faz a ponte, entre duas
sequências de DNA. Os autores denominaram esse mecanismo de
edição gênica de edição ponte.
Tendo em vista os sistemas de edição gênica relatados no texto precedente, julgue o item a seguir.
Os sistemas de edição gênica em apreço promovem rearranjos genômicos, pois, após as enzimas clivarem o DNA, os mecanismos de reparo inatos das células são acionados.
Após a utilização de programas para o processamento de micrografias adquiridas em um criomicroscópio de transmissão, um especialista na área deve ser capaz de estimar, por simples inspeção visual das densidades do mapa de potencial de Coulomb, sua resolução aproximada. Com base nas características observadas nos mapas de 1 a 4, apresentados a seguir, e em seu conhecimento sobre a estrutura de proteínas, assinale a alternativa que contém a estimativa de resolução que mais se aproxima da resolução predita pela correlação de Fourier.
Com relação aos conhecimentos em criomicroscopia eletrônica de transmissão e varredura, é correto afirmar:
Pesquisadores da instituição ‘A’ têm interesse na biologia estrutural de vírus e buscam caracterizar vírus da família Mimiviridae de ambientes como fossas vulcânicas, corais e derivados de petróleo. A meta dos pesquisadores é coletar informações em resolução atômica dos vírus no contexto de infecções, ou seja, no interior de células hospedeiras. Vírus dessa família despertam interesse devido à sua complexidade. Apresentam uma superfície icosaédrica, genomas de 1,2 Mb e tamanhos na faixa de 800 nm, sendo visíveis até mesmo por microscopia ótica. Além disso, sua superfície é coberta por uma densa camada de fibrilas. Outro grupo de pesquisadores, da Instituição ‘B’, têm interesse na resolução estrutural, em escala atômica, de proteínas com tamanho molecular entre 5-15 kD, quando complexadas a alvos farmacológicos de igual tamanho. Com base nessas informações, assinale a alternativa correta.
AlphaFold2 e suas aplicações nos campos da biologia e medicina
Em dezembro de 2020, o AlphaFold2 (AF2), um modelo baseado em aprendizado de máquina (machine learning) para prever estruturas de proteínas desenvolvido pela DeepMind, conquistou o campeonato na 14ª edição do Critical Assessment of Structure Prediction (CASP14). Um ano e meio depois, a DeepMind e o EMBL’s European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI) divulgaram as estruturas de mais de 200 milhões de proteínas previstas pelo AF2, que cobrem quase todas as proteínas conhecidas no planeta (o universo das proteínas). Esses dois eventos atraíram grande atenção para o AF2 na comunidade científica. O AF2 representa um avanço marco na previsão de estruturas de proteínas. Ele é considerado a maior contribuição da Inteligência Artificial (IA) para o campo científico e um dos maiores avanços científicos feitos pela humanidade no século XXI. Este é um feito histórico notável no entendimento humano da natureza. A alta avaliação do AF2 não é excessiva, pois entender as estruturas tridimensionais (3D) das proteínas é um dos problemas mais desafiadores no campo da biologia, que tem desconcertado os cientistas por 50 anos. Embora múltiplas tecnologias, incluindo Ressonância Magnética Nuclear (RMN), Cristalografia por Raios-X e Microscopia Crioeletrônica (cryoEM), tenham sido adotadas para resolver as estruturas das proteínas, apenas cerca de 200.000 estruturas de proteínas foram determinadas, cobrindo menos de 0,1% do universo das proteínas.
Adaptado de Yang, Z. et al. (2023). AlphaFold2 and its applications in the fields of biology and medicine. Sig Transduct Target. Tradução livre.
A estrutura terciária de uma proteína descreve a conformação tridimensional de toda a cadeia polipeptídica, resultante das interações entre os seus átomos e resíduos. Essas interações são fundamentais para a função biológica da proteína.
Considerando as características da estrutura terciária das proteínas, assinale a alternativa correta.
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