Questões de Concurso Para fuvest

A extração de ácidos nucleicos é uma etapa fundamental para diversas aplicações em biologia molecular, como PCR, qPCR e sequenciamento de RNA (RNA-seq). A escolha do método apropriado deve considerar fatores como pureza, integridade e concentração do material extraído. Além disso, a presença de contaminantes, como proteínas ou solventes orgânicos, pode interferir na qualidade das análises subsequentes. Para garantir resultados confiáveis, diversas estratégias de controle de qualidade são empregadas, como espectrofotometria, eletroforese e fluorimetria. Assinale a estratégia mais apropriada para garantir a qualidade do RNA extraído antes de análises transcriptômicas.

O aprendizado de máquina é amplamente aplicado na Bioinformática para analisar grandes volumes de dados biológicos, identificar padrões e realizar previsões. Métodos como classificação, clustering e redução de dimensionalidade são empregados para revelar estruturas subjacentes nos dados e facilitar a interpretação de fenômenos biológicos complexos. Técnicas como PCA (Análise de Componentes Principais), tSNE e UMAP são utilizadas para reduzir a dimensionalidade e visualizar agrupamentos naturais. Assinale a alternativa que representa uma aplicação adequada da redução de dimensionalidade em análises ômicas.

A reprodutibilidade é um princípio essencial em Bioinformática, permitindo que análises sejam repetidas com os mesmos dados e ferramentas em diferentes ambientes. Diversas estratégias podem ser adotadas para minimizar variações na execução de pipelines. Diante desse cenário, qual das abordagens a seguir representa a melhor estratégia para garantir a reprodutibilidade de um pipeline bioinformático? 

A análise multiômica combina diferentes camadas de dados biológicos, como transcriptômica, proteômica, metabolômica e microbiômica, para obter uma visão mais abrangente dos fenômenos celulares e fisiológicos. No entanto, a integração desses dados apresenta desafios computacionais e estatísticos significativos, especialmente ao tentar correlacionar diferentes tipos de informações geradas por técnicas distintas. Métodos baseados em redes de interação e aprendizado de máquina têm sido amplamente explorados para facilitar essa integração e revelar padrões biológicos complexos. Assinale a abordagem que representa corretamente um método eficiente para integração e análise de dados multiômicos.

A análise de variantes genômicas é um processo essencial em estudos de genética e genômica clínica, sendo composta por etapas como alinhamento de leituras, detecção de SNPs/INDELs, anotação e interpretação das variantes. Ferramentas como BWA, Bowtie, GATK, bcftools, ANNOVAR e VEP desempenham papéis fundamentais nesse pipeline. A escolha adequada dessas ferramentas pode impactar diretamente a qualidade dos resultados obtidos. Assinale a alternativa que descreve corretamente a importância da anotação de variantes em um estudo genômico.

A análise in silico de proteínas envolve diferentes abordagens para prever e interpretar suas estruturas e interações funcionais. Entre essas abordagens, destacam-se a modelagem comparativa, a predição ab initio, a análise de dinâmica molecular e o docking molecular. Ferramentas computacionais modernas auxiliam na interpretação dos resultados dessas análises, permitindo aplicações em descoberta de fármacos, design de proteínas e bioquímica estrutural. Assinale a alternativa que apresenta corretamente a principal característica da modelagem comparativa de proteínas.

Software como Progenesis e Protein Lynx Global Service (PLGS) são amplamente utilizados no processamento de dados de espectrometria de massas para proteômica e metabolômica. Essas ferramentas realizam etapas críticas, como alinhamento de picos, normalização, identificação de proteínas ou metabólitos e quantificação relativa entre amostras experimentais. Entretanto, a confiabilidade dos resultados depende de uma série de parâmetros e estratégias de controle de qualidade para reduzir falsos positivos e melhorar a interpretação biológica dos dados. Diante desse contexto, qual das alternativas apresenta corretamente uma estratégia fundamental para garantir a precisão dos resultados na análise proteômica e metabolômica utilizando PLGS ou Progenesis?

Diferentes estratégias de sequenciamento de RNA podem ser aplicadas para capturar distintas classes de moléculas, como mRNAs, pequenos RNAs e lncRNAs. A escolha do protocolo influencia a complexidade da análise, a profundidade da cobertura e a detecção de transcritos raros. Qual é a alternativa que melhor justifica a escolha do sequenciamento de RNA total em vez de um protocolo específico para mRNA, mesmo que isso acarrete maior complexidade analítica? 

No contexto do sequenciamento de genomas completos de microrganismos de interesse clínico, a seleção adequada da plataforma pode impactar diretamente a qualidade dos resultados e a interpretação dos dados. Assinale a alternativa que melhor justifica a escolha da plataforma de NGS para sequenciar um genoma microbiano completo:

A análise metabolômica envolve múltiplas etapas, desde a extração e preparo das amostras até a detecção dos metabólitos por técnicas como cromatografia líquida ou gasosa acoplada à espectrometria de massas. Após a aquisição dos dados brutos, são aplicadas diferentes estratégias computacionais para garantir a confiabilidade dos resultados. Com base nesse contexto, assinale a alternativa que melhor descreve a importância do pré-processamento na análise metabolômica.

A quantificação precisa de proteínas antes da digestão e análise proteômica é essencial para garantir a reprodutibilidade dos experimentos e a comparabilidade entre amostras. Técnicas como Bradford, BCA e métodos espectrofotométricos permitem normalizar a quantidade de proteína utilizada, evitando variações que possam comprometer a detecção por espectrometria de massas. Além disso, a escolha de estratégias adequadas para fracionamento e depleção de proteínas pode impactar a identificação de proteínas de baixa abundância, tornando-se um passo crítico em abordagens proteômicas quantitativas. Dentre as alternativas a seguir, assinale aquela que melhor justifica a importância da quantificação proteica antes da digestão enzimática e análise proteômica.

A proteômica baseia-se na identificação e quantificação de proteínas em amostras biológicas, muitas vezes por espectrometria de massas. Já a metabolômica foca nos metabólitos finais de processos celulares. A integração dessas abordagens permite uma compreensão mais completa do estado funcional de uma célula ou tecido, sendo especialmente útil em estudos que avaliam respostas a fármacos ou condições fisiológicas específicas. Qual das alternativas a seguir melhor descreve como a análise simultânea de proteoma e metaboloma pode fornecer informações mais completas sobre o impacto de um fármaco?

Ao adquirir um novo reagente, a ficha técnica informa que ele é estável a 4 °C por 1 mês e, para armazenamento de longo prazo (até 1 ano), deve ser mantido a -20 °C, evitando ciclos repetidos de congelamento e descongelamento. Você prevê que não utilizará todo o conteúdo do frasco dentro do primeiro mês. Qual é a melhor estratégia para garantir a integridade do reagente ao longo do tempo?

No contexto da execução de um projeto de pesquisa ou da publicação de um artigo científico, diversos procedimentos são recomendados para garantir a qualidade e a ética do trabalho. Assinale a alternativa que apresenta um procedimento ético e recomendado.

Uma equipe de desenvolvimento de software está adotando práticas de DevOps para melhorar a qualidade e a velocidade das entregas. Para isso, decidiram implementar um pipeline CI/CD, garantindo que todas as alterações de código sejam testadas e implantadas automaticamente. No fluxo definido, o pipeline segue as etapas:

1. O código é enviado para o repositório remoto, acionando o pipeline.

2. O código é analisado e testado por ferramentas automatizadas.

3. Se os testes passarem, um build é gerado e enviado para o ambiente de staging.

4. O código é revisado e validado antes de ser implantado em produção.

Após algumas execuções do pipeline, a equipe percebeu que, quando há falha nos testes automatizados, o código não é promovido para a próxima etapa. Além disso, alguns da equipe querem que a implantação em produção ocorra automaticamente, enquanto outros preferem que seja necessária uma aprovação manual.

Com base no cenário apresentado, assinale a alternativa correta.

Um cientista de dados deseja analisar um conjunto de dados tabular, pré processá-lo e treinar um modelo de rede neural para prever valores contínuos. Ele utiliza Pandas para manipulação dos dados, Scikit-learn para normalização e TensorFlow/Keras para construir o modelo.

Considere o seguinte código em Python:

Com base no código apresentado, assinale a alternativa correta sobre a execução e o comportamento desse modelo. 

Considere o seguinte trecho de código em Python, que tem como objetivo processar um arquivo de texto contendo dados numéricos e realizar operações sobre tais valores:

Garantindo que:

1. A média dos números lidos seja calculada e armazenada na variável media, mesmo que o arquivo esteja vazio.

2. Os números maiores que a média sejam gravados sempre em um novo arquivo chamado "saida.txt"

3. O código esteja protegido contra divisão por zero, de forma que a função tenha continuidade, mesmo que identificada a possibilidade de erro.

Assinale a alternativa que apresenta um código válido para continuar a função corretamente.

O versionamento de código é uma prática essencial no desenvolvimento de software, permitindo que múltiplos desenvolvedores colaborem de forma organizada, mantenham um histórico de alterações e revertam mudanças quando necessário. O Git, um dos sistemas de controle de versão mais populares, fornece uma série de comandos que auxiliam na gestão do código-fonte. Considere o seguinte conjunto de comandos executados em um repositório Git:

Com base nos comandos apresentados, assinale a alternativa correta.

Considere os dois trechos de código a seguir, ambos escritos na Linguagem R. O primeiro utiliza o pacote tidyverse, enquanto o segundo utiliza caret para o mesmo propósito. 

Em relação aos códigos apresentados, assinale a alternativa correta.

Um desenvolvedor foi contratado para criar um sistema web para uma pequena startup que deseja lançar um MVP (Produto Mínimo Viável) de uma plataforma de cursos online.

O objetivo inicial é disponibilizar um catálogo de cursos, permitir o cadastro de usuários e oferecer um painel administrativo para gerenciar os conteúdos.

A startup tem poucos recursos e precisa lançar a plataforma rapidamente. O desenvolvedor deseja escolher um framework que permita crescer e escalar o projeto futuramente, caso o produto tenha sucesso.

Considerando o cenário descrito, assinale a alternativa que apresenta a melhor escolha para o desenvolvedor e sua justificativa.