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Quando a causa primária do quadro de ME for encefalopatia hipoxicoisquêmica, o período entre o tratamento e a observação hospitalar deverá ser de, no mínimo, 24 horas.
No protocolo de ME, serão realizados dois exames clínicos, sendo um dos médicos responsável pelo exame clínico necessariamente da especialidade neurologia, neuropediatria ou neurocirurgia.
Presença de proteína 14-3-3 no líquor é considerado um biomarcador para doença priônica, como a síndrome de Gerstmann-Straussler-Scheinker.
O EEG pode ser utilizado no diagnóstico da doença de Creutzfeldt-Jakob, em que documenta um padrão gráfico sugestivo com a presença de ondas periódicas, bi ou trifásicas, máximas nas regiões anteriores.