O reconhecimento do custo com a folha de pagamento dos docentes deve ocorrer no momento do efetivo desembolso financeiro, para assegurar a rastreabilidade entre o sistema de custos e o fluxo de caixa da universidade.

A força de trabalho de estudantes estagiários ou residentes que atuam em Hospitais Universitários, por não gerar desembolso financeiro direto para a instituição, não deve ser mensurada ou atribuída como custo aos serviços de saúde prestados.

Na estrutura de custos da universidade, os cursos de graduação e as pesquisas entregues à sociedade são classificados como objetos de custos finais, ao passo que as unidades administrativas internas são consideradas objetos de custos intermediários.

Se a universidade identificar que o custo de processar a informação sobre o consumo de energia elétrica de um laboratório específico é superior ao benefício gerencial dessa informação, ela deve, obrigatoriamente, realizar o rateio desse valor para não ferir o princípio da integridade.

O valor referente a materiais de laboratório que sofreram deterioração física por armazenamento inadequado deve ser incorporado ao custo direto das pesquisas científicas em andamento, visando a recuperação do valor investido.