Auditoria operacional é voltada para a análise da economia, eficácia e eficiência da aplicação dos recursos e para a efetividade das ações governamentais. 

Auditoria de sistemas analisa os processos e os resultados governamentais em busca da excelência dos serviços públicos, por meio da avaliação da qualidade do uso dos recursos da entidade e das suas informações. 

Auditoria especial representa a avaliação global dos processos da entidade, partindo da análise dos principais fluxos e sistemas e desdobrando-se a todos os subprocessos e atividades. 

Auditoria integral consiste nos exames necessários devido a ocorrências imprevistas, solicitados ou determinados expressamente por autoridade competente, com a indicação dos fatos a serem verificados.