A execução dos trabalhos de auditoria deve seguir procedimentos definidos pelas NAGs, abrangendo etapas como planejamento, execução, comunicação dos resultados e monitoramento das recomendações.

A principal finalidade da auditoria governamental é responsabilizar penalmente os gestores públicos por falhas encontradas na aplicação dos recursos.

A auditoria de regularidade limita-se à verificação da conformidade legal dos atos administrativos, sem examinar demonstrações contábeis ou sistemas de controle interno.

A auditoria operacional tem como foco exclusivo os aspectos financeiros e patrimoniais dos entes auditados.

As Normas de Auditoria Governamental (NAGs) são aplicáveis apenas aos Tribunais de Contas estaduais, não sendo exigidas no âmbito federal.