A localização montanhosa no interior do estado cria um clima frio durante todo o ano, com neve frequente durante o inverno. Os ecossistemas são caracterizados por tundras e florestas boreais.

A localização próxima ao Equador resulta em um clima quente e úmido em todo o estado, com pouca variação sazonal. Os ecossistemas são predominantemente savanas e áreas de cerrado.

A proximidade das Serras Catarinenses e da costa do Atlântico contribui para uma grande variação climática, com regiões mais frias nas serras e clima tropical nas áreas litorâneas. Isso também influencia a diversidade de ecossistemas, como florestas de araucárias nas serras e manguezais na costa.

A localização costeira de Santa Catarina resulta em um clima tropical úmido durante todo o ano, com chuvas frequentes e altas temperaturas. A vegetação predominante é a floresta tropical.